麹允，是凉州金城（今甘肃兰州）人。麹氏与游氏世代为豪族，西州因此有歌谣：“麹与游，牛羊不数头。南开朱门，北望青楼。” 

永嘉五年（311年），汉赵攻陷洛阳（今河南洛阳），掳走晋怀帝司马炽，阎鼎等人在长安（今陕西西安）拥立秦王司马邺为皇太子，阎鼎总理百官。麹允当时担任安夷护军、始平太守，心中妒忌阎鼎的功劳，并且设法躲避他的权势。因阎鼎杀死京兆太守梁综，麹允便与梁综的弟弟冯翊太守梁纬等人攻打阎鼎，阎鼎逃走。 

永嘉六年（312年），雍州刺史贾疋讨伐贼寇张连，被张连所杀（一说被匈奴屠各部所杀），于是众人推举麹允兼任雍州刺史 ，作为盟主，按照朝廷制度，选拔设置官员。 

建兴元年（313年），司马邺即皇帝位，是为晋愍帝。晋愍帝任命麹允为尚书左仆射、领军将军、持节、西戎校尉、录尚书事 ，并仍然担任雍州刺史。当时汉赵将领刘曜、殷凯、赵染数万人进逼长安，麹允击败他们，在阵前生擒殷凯。 

建兴三年（315年）九月，刘曜攻打北地郡，麹允为大都督、骠骑将军。十月，麹允进攻并驻军在青白城以援救北地郡。 刘曜听说后转而进犯上郡，当时麹允在灵武扎营，因兵力弱不敢前进。 

建兴四年（316年）七月，刘曜再度围攻北地郡，北地郡太守麹昌派信使向麹允求救，麹允率领步兵、骑兵三万人赶赴北地郡。麹允离城数十里，群贼绕城放火，烟尘遮天，刘曜放出间谍骗麹允说：“郡城已经陷落，焚烧将尽，要救援也来不及了。”麹允相信了，朝廷军队众兵非常惊惧，不战而溃散。过了几天，麹昌突围奔赴长安 ，北地郡就此陷落。 

麹允生性仁厚，没有威严不果断，吴皮、王隐一类的无赖恶人，都加封重爵，新平太守竺恢、始平太守杨像、扶风太守竺爽、安定太守焦嵩，全部升任征镇镇守一方，加封侍中、常侍，小到村庄主帅，都赐予银青、将军之号，为的是安抚笼络众心。然而诸将骄横恣肆，不给下级恩惠，人情离散，因此羌胡跋扈，关中混乱。 

建兴四年（316年）八月，刘曜率军围攻长安，长安城内外断绝联系。 十月，长安城发生严重饥荒，米价一斗达到黄金二两，并出现人吃人的情况，长安城中一大半人饿死。太仓中有酿酒用的曲饼数十块，麴允将曲饼砸碎熬粥给晋愍帝喝，不久，曲饼也已经吃光了。晋愍帝哭着对麴允说，如今穷困危急到这种地步，外面没有救援，为社稷而死是他所应该的。但想到将士们遭受的磨难，应趁城未陷落而行全身之计，或许可以使百姓免受屠戮之苦。于是准备向汉赵投降。 

十一月十一日，晋愍帝派侍中宋敞向刘曜送上降书，投降汉赵。 晋愍帝在出城投降汉赵前，叹息说：“误我事的人，是麹、索二公。”十一月十七日，晋愍帝被送往平阳过流亡生活，麴允和群官都跟从到平阳。 晋愍帝遭到汉赵皇帝刘聪的幽禁侮辱，麹允伏地号哭不能起身。刘聪大怒，把麹允幽禁在监狱，麹允发愤自杀。刘聪赞许麹允的忠烈，追赠他为车骑将军，谥号节愍侯。