王脩七岁时死了母亲。他的母亲是在社日那一天死的，第二年邻里在社日祭祀祭神，王脩因感触而思念母亲，非常悲哀。邻里听到他的哀哭声，因此停止了祭神。二十岁时，王脩到南阳游学，住宿在张奉家里。张奉全家人都生了病，没有人去看望他们，王脩怜悯他们，亲自照料他们，直到他们病好了才离开。

初平年间，北海孔融徵召他任主簿，代理高密令。高密人孙氏素来强横任侠，他的门客多次犯法。民间有抢劫案发生，贼人进入孙氏门下，吏役无法去捉拿。王脩带领吏役百姓包围了孙氏家，孙氏抗拒防守，吏役百姓畏惧不敢靠近。王脩命令他们：“有敢不去攻打的人，与贼人一同治罪。”孙氏害怕了，于是交出了抢贼。从此当地横行不法的豪强都惧怕屈服。王脩被推举为孝廉，他让给了邴原，孔融没有答应。当时天下动乱，推举孝廉的事停了下来。不久，郡中有谋反的人。王脩听说孔融有危难，连夜奔往孔融那里。贼寇刚刚起事时，孔融对左右的人说： “能冒着危难前来帮我的，只有王脩了。”话刚说完，王脩就到了。后来王脩又任功曹。当时胶东多有贼寇，孔融又命王脩为胶东县令。胶东人公沙卢宗族强盛，自己设置营寨壕堑，不肯听从官府的发派调遣。王脩独自带领几个人骑马径直闯进公沙卢家中，斩杀了公沙卢兄弟几人，公沙氏族人震动惊愕，没有人敢有举动。王脩安抚了其余的人，自此贼寇逐渐止息。孔融每次有了危难，王脩即使是在家里休息归养，没有不马上到的。孔融往往倚仗王脩得以免于祸患。

袁谭在青州时，征召王脩为治中从事，别驾刘献几次诽谤诬陷王脩。后来刘献因事当判死罪，王脩审理这件案子，刘献得以免于一死。当时人因此更加称赞王脩。袁绍又征召王脩任即墨县令，后又任袁谭手下的别驾。建安七年(202年)，袁绍病死，因审配等伪立袁绍遗令，拥立袁尚为主，袁谭与袁尚渐生嫌隙。到了建安八年(203年)，袁谭和袁尚开始刀兵相向，双方在黎阳外城城门交战，袁谭战败，就率领部队退回南皮。王脩率领吏役百姓前往营救袁谭。袁谭高兴地说：“成全我的部队的人，就是王别驾啊!”袁谭战败时，刘询在漯阴起兵，各个城池都起来响应。袁谭叹息说：“现在全州都背叛了我，难道是因为我不讲德行吗?”王脩说：“东莱太守管统虽远在海外，但这人不会反叛，他一定会来。”十几天后，管统果然抛妻弃子来到袁谭这里，妻儿被叛贼杀害。袁谭让管统改任乐安太守。袁谭又想进攻袁尚，王脩劝他说：“兄弟之间往复攻击，这是走向失败灭亡的道路啊!”袁谭不高兴，但理解他的志向节操。过后袁谭又问王脩：“有什么计策可以使用?”王脩说：“兄弟就像一个人的左右手。比如一个人将要与别人角斗，却砍断了他的右手，反而说‘我一定能胜’，像这样行吗?抛弃了兄弟，不相亲近，天下人还有谁能亲近!您的部下有进谗言的人，本来就在你们兄弟之间参与争斗，以求取有朝一日的利益，我愿意明白地告诉使君：堵上耳朵不要听他们的。如能斩杀几个奸佞的臣下，兄弟重新亲近和睦，以抗御四面八方的敌人，可以凭这个横行天下。”袁谭没有听从。袁尚又亲自率兵攻打袁谭，袁谭迎战大败，环城坚守。袁尚死命围攻，袁谭逃往平原，并派辛毗去向曹操求救。

曹操攻破了冀州以后，袁谭又背叛了曹操。曹操于是带领军队在南皮进攻袁谭。王脩这时运送粮食正在乐安，听说袁谭危急，率领他带去的士兵和属下的从事一共几十人，向袁谭那里赶赴。到了高密县时，听到袁谭已死的消息，王脩下马放声大哭，说：“没有您，我回到哪里去啊?”于是去了曹操那里，请求让他收葬袁谭的尸体。曹操想要观察王脩的诚意，沉默着一声不吭。王脩又说：“我曾受过袁氏的厚恩，如果让我得以收殓袁谭尸体，然后让我就死，我也不会后悔。”曹操称赞他的义气，听从了他。曹操让王脩担任督军粮，返回乐安。袁谭被击破后，全州各个城池都服从了曹操，惟独管统据守乐安，不愿服从。曹操命令王脩去取管统首级，王脩因为管统是亡国的忠臣，于是解开他的捆绑，让他去见曹操。曹操高兴并且赦免了他。袁氏政令宽纵，在职的有权势的人大多都积聚财物。曹操攻破邺城，查抄没收审配等人的家财数以万计。待到攻破南皮县，察看王脩家，粮谷不满十斛，仅有书籍几百卷。曹操感叹着说：“王脩作为士人真是名符其实。”于是礼聘王脩为司空掾，代理司金中郎将，迁为魏郡太守。

王脩治理政务，抑制豪强，扶助弱小，赏罚分明，为百姓所称道。建安十八年(213年)，王脩被封为大司农郎中令。曹操欲行肉刑，王脩认为时机还不允许实行，太祖采纳了他的建议。调王脩为奉尚。后来严才反叛，与他的属下几十人攻打宫殿旁门。王脩听说兵变，召唤车马未到，就率领属下官吏步行到了宫门。太祖在铜爵台望到他们，说：“那赶来的人一定是王叔治。”相国钟繇对王脩说：“过去，京城发生变故时，九卿是各自居守官府不出。”王脩说：“靠国家的薪俸吃饭，怎么能躲避国家的危难呢?居守官府虽是旧制，但不符合奔赴危难的大义。”不久，王脩病死在任上。其墓在安丘城南四十里。