冯治安有一颗炽烈的爱国心，对日本帝国主义鲸吞中国的狼子野心十分愤慨。1933年他率部参加长城喜峰口抗战，与日寇多次血战，据说一夜之间用大刀砍杀日寇5000人。1937年“七七”事变爆发前，何基沣旅长向冯治安(师长)报告敌情后，冯星夜赶抵驻地布置了应战准备。他下令说：此地为平津咽喉，华北锁钥，至关重要，务必固守，不准日军一兵一卒进入，不准放弃一寸国土。他命令驻宛平的吉星文团长：一旦日寇挑衅就坚决反击，为维护国家主权及领土完整，可采取武力自卫断然处置，设若冲突，卢沟桥即是你们的坟墓。吉星文团在冯治安、何基沣指挥下，打响了神圣的全民族抗战第一枪。中共中央对冯治安坚决抗战给予了高度评价，在通电中说：“我们应该赞扬和拥护冯治安部的英勇抗战。”这是党和人民对他抗日爱国热情的肯定。

抗日战争期间，冯治安与中国共产党和新四军保持了较好的统战关系。何基沣秘密访问延安后向他报告了此行经过，并建议他仿照共产党和八路军的治军方法，他既未同意，亦未将何出卖。后来从延安来了许多共产党员秘密进入该部，说他一无所知也不见得，不过他基本上采取开一只眼闭一只眼的态度。他还暗中批准何基沣将一些枪支弹药赠送给新四军第四师和第五师。这些情况陈毅都是知道的。但是，在那个特定的历史时代，作为一个复杂的历史人物，冯治安的基本立场是保存实力，为此他巧妙地周旋于各种政治力量之间。他曾对人说：“冯玉祥下台是过于亲共，宋哲元垮掉是抗日太突出，张自忠阵亡是反蒋太卖力。”他认为自己的高明之处是既对蒋介石不满并保持若即若离，但又不公开反蒋;既和共产党搞统战，又不显得太“红”;既抗日，又保住了部队实力。

八年抗战，冯治安大部时间在鄂西北与日寇周旋，艰难拼杀，官阶升到33集团军总司令。抗战胜利后，蒋介石发动反共内战，冯治安奉调徐州，任第三绥靖区长官，被推上内战前线。1948年底淮海战役刚打响，冯治安最亲密的助手、多年的拜把兄弟、后来成为秘密共产党员的何基沣将军，会同张克侠将军，策动起义成功，拉走了大部人马，冯治安一下成了光杆司令，遭到蒋介石的痛斥和国民党将领们的责骂，大有皆曰可杀之势，冯遂身败名裂。后来他随蒋去台，郁郁苟活，于1954年突患脑溢血病逝，终年58岁。