1927年初，俞保元由叔父俞甫才介绍加入中国共产党。不久到武汉国民党江苏省党部党务训练班学习，6个月后回上海。不久遭国民党反动军警逮捕。后经中共党组织营救回崇。

1928年8月，中共江苏省委农民部派杨思公和严震来崇担任临时县委负责人。杨、严与俞保元等人在三星、海桥、堡镇、汲浜一带发动群众，并在南盘附近成立了有百余人参加的雇农会。同时恢复党组织，在东部地区建立了3个党支部。1929年12月，俞保元化名蔡昌，任中共崇明县委书记，并兼一区的工作。当时党组织屡遭反动当局破坏，俞以小学教师身份作掩护，深入工厂、农村，进行艰苦的工作，使党组织又有所发展。

1929年底，俞保元和县委委员施季麟等秘密去堡镇大通纱厂，发动工人罢工，迫使资本家给工人增加工资。在农村，他们组织农民开展减租减息斗争。

1930年，中共江苏省委指示县委在“五·一”国际劳动节组织暴动。4月12日晚，县委在堡镇西面海界宅召开全县工农兵代表会议，研究在“五·一”节示威游行和罢工等问题。由于地下党员刘金甫叛变，会议将结束时，突遭国民党军警袭击，到会48名代表全部被捕。俞保元、施季麟、郁志翘等12人被押往上海淞沪警备司令部，监禁于漕河泾监狱。

俞保元被判9年徒刑。他在狱中坚持斗争，因组织难友越狱失败，于1930年9月9日在龙华英勇就义。