1949年3月，中国人民解放军粤桂边纵队第三支队派卢金灿（化名卢彪）回扶南县开展革命活动，介绍张华（曾东江的化名）与邓奇干认识，在邓奇干家设立扶南联络站，委邓为站长。4月初，加入中国共产党。6月，由扶南、同正、邕宁、南宁来的青年一百多人，经邓奇干分三批送往十万大山游击区受训。由山区来的同志，也常住在他家。邓奇干全家支持革命，日夜忙着招待路过的同志食宿。 

为迎接解放军南下，邓奇干以驮辽、渠隆为据点，以三哈村为重点，秘密组织农会。动员农村知识青年参加革命活动，并负责指挥驮辽武工队，1949年9月间，邓奇干率领武工队在岜白村伏击由绥渌到扶南国民党县警，缴获七九步枪和驳壳枪各一支。11月，国民党扶南县长黄济夫星夜向上思方向窜逃，邓奇干带领武装民兵于营陇、岂邦两村间伏击，活捉县府秘书陈美富。 

建国后，邓奇于任扶南县副县长，发动群众支援南下大军。1950年2月，扶南县土匪暴乱，邓奇干率领县大队及征粮工作队四十多人，深入土匪控制的竹琴村宣传党的政策，发动群众交公粮。被300多名土匪包围，激战四个多小时，在突围中不幸中弹牺牲。