民国29年起，马仲殊长期在上海的中学和师范学校任教，一边教学，一边创作。著有短篇小说《三太爷》、《李星》、《屈服》、《京沪线上》、《邂逅》等；长篇小说有《两难》、《一个中学生的日记》、《桃色的云》；译著有《大地》、《儿子们》（美作家赛珍珠所作）；文学理论有《文学概论》、《中国现代文学思潮》、《小说作法大纲》、《中学生文学》、《中学生小说作法》等。抗日战争期间，担任《前线报》笔政，以“老秀”笔名创作了诗歌、剧本。建国后，马仲殊担任上海市中学教师进修学院中文系副主任、副教授。曾计划写作《鲁迅传》未成。1958年1月26日，马仲殊病逝于上海，年58岁。其生平被《中国文学家辞典》收录。