1988年,边第五被关在牢里的时候,遇到一个死囚犯,是他告诉边第五说老妖山的地下埋藏有黄金,所以才有了后面边第五找五虎兄弟来老妖山找黄金的事情。警方还没赶到玉米地中的房屋,就听到了爆炸声,不远处的商全亮也听见了。警方赶至,抓到了赵长海,赵长海在昏迷之前说,老刀子挟持了一个人去老妖山寻黄金,以及他弟弟被绑架一事,老四、边第五和另外一人因爆炸而横尸当场。老五出现,商全亮认出他是昨天搭车的哑巴,并注意到他脚上穿着柳河县医院的鞋,察觉到他不是好人,想过去找警察,但老五一眼就看出他想干什么,立即将他拉进玉米地里打晕了。
王云带着省城医院的病理学专家孙明教授来到柳河县医院,他们告诉商瑾,初步检测后怀疑是一种从未发现过的致病体导致的人体死亡,目前来看,像是某种鼠疫、狂犬病和朊病毒的结合。孙明教授和商瑾解释了朊病毒,四年前英国爆发的疯牛病病原就是朊病毒。至于死者尸体上出现的奇怪组织,目前还不清楚是什么,但不像是自然界形成的。调查死者生前的行动轨迹,应该能找出一些线索。商瑾虽然没去过老妖山,但是商全亮对老妖山的地形很熟悉。此时的老商醒来,头上被砸了一个血洞,救护车来把他拉去治疗,队长吩咐几个人留下搜捕,其他人立即上山抓捕老刀子。
待警察离开,老五才从玉米地里出来。与此同时,关押赵长海弟弟和妹妹的窝点也被警察端了。大雨终于醒来,贺雪琴出去给他买他想吃的鸡蛋糕,刚一出门就看到了淑芬。两人去河边谈话,淑芬当初有大雨的时候才十八岁,因为害怕未婚先孕曝光,所以狠心丢弃了大雨。此番前来她不是为了带大雨走,而是想来看看他过得好不好。看到贺雪琴把大雨当成亲人一样对待,淑芬终于放心,给贺雪琴留了一笔钱,算是弥补自己遗弃大雨犯下的错。之后,淑芬就坐上了回平山的车。贺雪琴把鸡蛋糕买了回来,叫大雨却没反应,她以为大雨又睡着了。警方赶到老妖山,上山寻找老刀子踪迹。
商瑾带王云和孙明教授来医院找商全亮,谈了一会儿后,商全亮就准备去老妖山,还没出医院门,就碰到贺雪琴把大雨带来医院治疗。高英勇看到商瑾,朝她打招呼,商瑾却没记起他是哪位。商全亮和商瑾父子开了孙明教授的车上山,尾箱里还有一些防护装备。老二将老刀子带到地下通道的入口处,老刀子就一枪把老二打死,独自一人进入了地下通道。不出一会儿,他就被幻觉吓到,慌忙跑出来。警方根据枪声摸过来,与老刀子火拼。胡廷从后偷袭,两人纠缠了很久,胡廷才把老刀子制服。商家父女穿上防护装备,边进山边喊胡廷,声音很快被老三发现,老三躲在他们的身后突袭。
商全亮打不过身强力壮的老三,被他打得不轻,商瑾也受了伤,小兔崽子解开裤腰带要对商瑾行不轨,商全亮发现猎枪,拿起来对他扣动扳机将其打死。本以为转危为安,又来了个老五,商瑾求他不要杀自己的老爹,商全亮不屑于求他。幸好此时猎枪里没子弹了,老五给了他一拳后背着猎枪离开,走出几十米远后踩到地雷炸死了,这就是所谓的恶人有恶报,早早晚晚。胡廷听到枪声,赶了过来,得知半个犯罪团伙差点都让商全亮父女解决完了,不禁夸起商全亮。胡廷联系不上队长他们,担心他们进入地道会感染,商全亮主动说要去找她们,毕竟老妖山的地形他比较熟悉。
后来,县里给商全亮举办表彰大会,看到台下商瑾为自己自豪的样子,商全亮的长篇大论发言突然凝缩成了几句,真实地表达了他此时的感受。经过检测,孙明教授说这个病毒有可能是一种有指向性的基因重组,王云提了一下,会不会是日本人搞的生化实验。经过这些事情,商全亮写了一部科幻小说,第一部叫《立功》,第二部叫《归来》,有些故事,到这里还没有结尾。
全剧终。