该剧将再现百年前蔡锷将军为反对袁世凯复辟称帝而发动“护国运动”的始末。电视剧将在尊重历史的前提下，为观众展现蔡锷将军在特定历史时期的风云传奇。 《护国军魂传奇》讲述重九起义后蔡锷及家人被袁世凯“请”到京城，扣为人质，蔡锷在看清袁世凯真面目后， 破除重重困难，经日本，转台湾、香港地区，再过越南，最终返回云南反袁的故事。 1911年10月30日，蔡锷在云南发动重九起义，响应武昌起义，大清朝终于在众多有识之士的努力下，落下了帷幕。 重九起义两年之后，蔡锷被临时大总统袁世凯调到北京，多方势力角逐，危机始终围绕蔡锷。 蔡锷为麻痹袁世凯，将自己扮成风流军人，并且结识了京城名妓小凤仙，在确认袁世凯一心称帝的真面目后，蔡锷下定决心反袁。 在各方人士的协助下，蔡锷逃离北京，回到云南，发动了声讨袁世凯复辟的护国起义。